基本上，任何的咖啡處理法都是為了要清除咖啡豆的外皮和果肉並將咖啡豆乾燥至適合出口的水分含量（通常為 11-12%）。
實際處理技術差異很大，但我們可以廣泛的區分出三種最常見的技術，它們是：水洗、日曬和蜜處理。
水洗法
這是精品咖啡中最常見的處理方法。新鮮採收的咖啡果實會被根據成熟度進行分類，並在收穫後24小時內去除外皮和果膠層。在去除果肉之前，咖啡果實會被放入水中進行漂浮測試，篩除漂浮在水面上的瑕疵豆。之後，果實會被放入果肉去除機，去除果皮和果肉。
去除果肉後，表面黏稠的咖啡豆和剩餘的果肉通常會放入發酵槽12-36 小時。所有的咖啡處理方法都包含發酵階段，而水洗法的發酵過程比其他咖啡處理法更加精緻。發酵能幫助果膠層從咖啡豆上脫落，這樣在清洗時更容易去除。
發酵後，咖啡豆會被放入清水中清洗，並放置在平坦的表面上晾乾。為確保均勻乾燥，咖啡豆每日會被固定翻動幾次。咖啡充分乾燥後，便會裝袋並準備運送給咖啡烘焙師。
水洗咖啡的風味特徵通常比其他咖啡更加乾淨和細膩，具有明顯的酸度和清爽的口感。
日曬法
這是最古老的咖啡處理方法，它不需要水所以更環保。在果實乾燥的過程中，不會進行其他的處理。在果實充分乾燥後，才會去除外皮和果肉。果實在成熟時採收，因為成熟的果肉會在乾燥過程中賦予咖啡豆風味。就像水洗法一樣，咖啡果實會被放置在平坦的表面上進行乾燥，而最好的乾燥方式是放置在架高的平台上，讓氣流能在整個果實周圍移動。要讓果實充分乾燥並讓種子達到11%的水分含量可能需要3-4週的時間。乾燥後，果實會被放入機器中去除乾燥的外果皮、果肉和內果皮。經過最後的分類後，咖啡就能裝袋準備發貨。
與水洗咖啡相比，日曬咖啡的味道通常更鮮明，具有濃郁的質地和果香味。
蜜處理
蜜處理介於水洗法和日曬法之間。就像水洗咖啡一樣，果皮在採收後24小時內會被去除。而果膠層會被留在咖啡豆上晾乾，如同日曬法一樣。蜜處理也不需要使用水，因此比水洗法更環保。果實可以通過多種方式進行乾燥，包括在陽光充足的露台上直接曝曬，或堆放在溫室中進行更長時間的發酵，然後再攤平進行乾燥。整個過程需要3-4週，取決於天氣情況。
新浪潮
在咖啡界，越來越多渴望提升咖啡品質的農民，開始尋求科學和其他產業的協助。他們採用全新的技術，與他們的祖輩所遵循的傳統做法大相逕庭。這給了消費者在一杯咖啡中品嚐到全新的風味世界。
其中一項新興技術被稱為厭氧發酵法。該方法來自葡萄酒工業，其主要思想是在無氧條件下進行咖啡果實（或豆子）的發酵。由此產生的是一些特定的熱帶水果、香檳等風味，這些風味在咖啡中很罕見，只會在這些特殊的條件下出現。
這樣的咖啡是為那些在日常咖啡飲用中尋求新體驗的人所設計。